K Dense Ai Scientific Agent Skills
合集@K-Dense-AI4.5万+开源协议: MIT
如何使用 Adaptyv Bio Foundry API 和 Python SDK 进行蛋白质实验设计、提交以及结果获取。每当用户提及 Adaptyv、Foun…
molecular-dynamics
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 OpenMM 与 MDAnalysis 运行和分析分子动力学模拟。可搭建蛋白/小分子体系、定义力场、执行能量最小化与成品 MD 计算，并对轨迹进行分析（R…
*/molfeat
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 面向机器学习的分子特征化工具（100+ 特征器）。支持 ECFP、MACCS、描述符、预训练模型（ChemBERTa），可将 SMILES 转换为特征，用于 Q…
*/ncats-arax
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 查询 NCATS Translator ARAX 生产 API，以获取有界、类型明确且来源信息丰富的一跳和固定端点的两跳生物医学知识图谱关系。适用于 Bioli…
*/networkx
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 NetworkX 在 Python 中创建、分析和可视化复杂网络与图。适用于处理网络/图数据结构、计算图算法（最短路径、中心性、聚类）、检测社区、生成合成…
*/neurokit2
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 NeuroKit2 构建或审查生理时序预处理的可复现研究工作流，涵盖事件/区间分析、多模态对齐、变异性与复杂性。当代码导入 neurokit2 或需要其当…
*/neuropixels-analysis
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 SpikeInterface 对 Neuropixels 胞外电生理记录进行端到端分析。涵盖加载 SpikeGLX / Open Ephys / NWB …
*/nextflow
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 端到端地构建、运行与调试 Nextflow 数据流水线及 nf-core 工作流。在用户提及 Nextflow、nf-core、.nf 文件、nextflow.…
*/omero-integration
@K-Dense-AI
流程自动化开源协议: MIT
/**
* 使用 omero-py、BlitzGateway、OMERO CLI、tables、annotations、ROIs、rendering 以及文档化的 OMER…
*/onekgpd
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 按个体层面查询 1000 Genomes Project 数据集（3,202 名全基因组测序个体，GRCh38）。 用于问题涉及 1000 Genomes Pr…
*/ontology-term-resolution
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 将自由文本形式的科学标签解析为本体术语 ID，并对照 EBI Ontology Lookup Service (OLS4) 校验已有的 CURIE。每当需要生成…
*/open-notebook
@K-Dense-AI
流程自动化开源协议: MIT
/**
* Self-hosted, open-source alternative to Google NotebookLM for AI-powered researc…
*/openpiv
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 OpenPIV 进行粒子图像测速（PIV）分析。适用于从 PIV 图像对中提取速度场、分析流体动力学或流动可视化实验、对查询窗口进行互相关、验证并替换异常…
*/opentrons-integration
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 为 Flex 和 OT-2 机器人编写、审查、迁移、模拟并排查官方 Opentrons Python Protocol API v2 协议。用于机器人特定的液体…
*/optimize-for-gpu
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 在 NVIDIA 硬件上为科学计算 Python 提供 GPU 加速，并验证结果既正确又更快。适用于 CUDA/GPU 优化；CPU 密集型的 NumPy、Sc…
*/pacsomatic
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 面向 nf-core/pacsomatic 配对肿瘤-正常流程（BAM 输入）的运维工具包。当用户需要校验运行输入、生成符合 pacsomatic 规范的样本表…
*/paper-lookup
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 搜索 11 个学术文献 API，查找论文、预印本、引文和开放获取的全文，并附带可复现的来源信息返回结果。涵盖 PubMed、PMC（全文）、Europe PMC…
*/paperclip
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 通过 GXL 的 Paperclip CLI 搜索并阅读全文生物医学论文、FDA/PMDA/EMA 监管文件、临床试验注册库以及 UniProt/PDB/ChE…
*/paperzilla
@K-Dense-AI
流程自动化开源协议: MIT
/**
* 与你的智能体讨论 Paperzilla 中的项目、推荐和权威论文。用于用户请求最近的论文推荐、权威论文详情、基于 markdown 的摘要、推荐反馈、信息源导出…
*/parallel-web
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 Parallel CLI 进行网页搜索、URL 内容提取、深度研究、结构化数据补全、实体发现以及周期性网页监控。最适合明确需要当前网页证据、学术来源发现、…
*/pathml
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 PathML 进行本地、仅用于研究的计算病理学工作流：加载与切分切片、构建预处理与 QC 流水线、管理 h5path 数据、对多重图像进行量化、构建空间图…
*/pathogen-variant-surveillance
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 通过 GenSpectrum LAPIS API 查询实时病原体基因组监测数据，以了解当前流行的病毒谱系、其增长速度以及所携带的突变。当问题的答案取决于病原体群…
*/pathway-enrichment
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 对基因列表或排序后的基因数据运行通路与基因集富集分析，并解读结果。当用户给出一组基因（来自 PyDESeq2/Scanpy 的差异表达基因、CRISPR 筛选命…
*/@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 每当用户希望对 PDF 文件进行任何操作时，请使用此技能。这包括读取或提取 PDF 中的文本/表格、合并或合并多个 PDF、拆分 PDF、旋转页面、添加水印、创…
*/peer-review
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 准备有证据约束的、建设性的同行评审草案以及结构化的手稿评估意见。用于对科学手稿、研究方案、预印本或研究项目申请书进行经授权的评审；报告指南的选择；声称–证据核对…
*/