K Dense Ai Scientific Agent Skills
合集@K-Dense-AI4.5万+开源协议: MIT
如何使用 Adaptyv Bio Foundry API 和 Python SDK 进行蛋白质实验设计、提交以及结果获取。每当用户提及 Adaptyv、Foun…
pennylane
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
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* 与硬件无关的量子机器学习框架，支持自动微分。适用于通过梯度训练量子电路、构建量子-经典混合模型，或需要在 IBM/Google/Rigetti/IonQ 之间实…
*/phylogenetics
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编程协作开源协议: MIT
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* 使用 MAFFT（多序列比对）、IQ-TREE 2（最大似然法）和 FastTree（快速 NJ/ML）构建并分析系统发育树。通过 ETE3 或 FigTree…
*/pi-agent
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编程协作开源协议: MIT
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* 使用 Pi 构建与开发，Pi 是一个极简的终端编程工具。可用于安装 Pi、配置 provider/模型/设置/环境变量、创建 Pi 技能/扩展/包/主题/提示模…
*/pkpd-modeling
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编程协作开源协议: MIT
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* 药代动力学与药效动力学建模与模拟——非房室分析、房室模型与群体 PK、PK/PD 与暴露-反应关系、TMDD、PBPK 入门、生物等效性、异速生长比例缩放与首次…
*/polars
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编程协作开源协议: MIT
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* 用于 Python ETL、分析和 pandas 迁移的高性能 DataFrame 库。可用于基于表达式的数据操作，支持惰性查询优化、并行执行、流式超出内存处理…
*/polars-bio
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编程协作开源协议: MIT
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* High-performance genomic interval operations and bioinformatics file I/O on Pola…
*/pptx
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编程协作开源协议: MIT
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* 任何时候只要涉及 .pptx 或 .potx 文件——无论是作为输入、输出还是两者兼有——都应使用本技能。具体包括：创建幻灯片组、推介稿或演示文稿；读取、解析或…
*/pptx-posters
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编程协作开源协议: MIT
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* 在不含宏的 PowerPoint (.pptx) 中,基于作者已批准的本地内容和素材,创建并审计可编辑的科学海报。当请求的可交付成果是 PowerPoint 研…
*/primekg
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编程协作开源协议: MIT
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* 查询 Precision Medicine Knowledge Graph（PrimeKG），获取多尺度生物数据，包括基因、药物、疾病、表型等。
*/protocolsio-integration
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设计多媒体开源协议: MIT
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* 读取、校验并安全导出 protocols.io 数据，遵循当前官方 REST/MCP 契约，或生成非执行的变更计划。捆绑的客户端仅向官方主机发起有界的 GET …
*/pufferlib
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编程协作开源协议: MIT
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* 版本感知的 PufferLib 强化学习环境、向量化、策略、PuffeRL 训练、评估与安全 checkpoint 审查指南。用于将 Gymnasium/Pet…
*/pydeseq2
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编程协作开源协议: MIT
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* 针对 bulk RNA-seq 的差异基因表达分析（使用 PyDESeq2），涵盖公式化设计、Wald 检验、FDR 校正、LFC 收缩以及结果可视化。
*/pydicom
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 pydicom 读取、检查、写入、转换本地 DICOM 数据集与像素数据，并进行安全的预检。涵盖 DICOM 元数据、传输语法、压缩插件、帧、私有元素、J…
*/pyhealth
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编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 PyHealth 构建临床/医疗深度学习流水线 — 加载 EHR/信号/影像数据集（MIMIC-III/IV、eICU、OMOP、SleepEDF、Che…
*/pylabrobot
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流程自动化开源协议: MIT
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* 开发和审查 PyLabRobot 实验自动化资源、液体处理方案、离线仿真以及受支持的设备集成。用于 PyLabRobot 协议或 API 相关问题；将实物执行操…
*/pymatgen
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编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用当前 pymatgen API 分析、验证、转换与处理材料结构及计算材料数据，包括局域相图、对称性敏感度、电子结构 I/O，以及显式受限的 Material…
*/pymc
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 PyMC 进行贝叶斯建模。构建分层模型、MCMC (NUTS)、变分推断、LOO/WAIC 比较、后验检查，用于概率编程与推断。
*/pymoo
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 多目标优化框架。包含 NSGA-II、NSGA-III、MOEA/D、Pareto 前沿、约束处理、基准测试（ZDT、DTLZ），用于工程设计和优化问题。
*/pyopenms
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编程协作开源协议: MIT
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* 完整的质谱分析平台。用于蛋白质组学和代谢组学工作流——特征检测、肽段/蛋白质鉴定、非标记定量和等质量标签定量、加合物/精确质量注释，以及复杂的 LC-MS/MS…
*/pysam
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编程协作开源协议: MIT
/**
* 用于基因组文件的 Python/HTSlib 工作流。当使用 pysam 读取、查询、筛选或写入 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FAST…
*/pytdc
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编程协作开源协议: MIT
/**
* 通过 PyTDC Python 包使用 Therapeutics Data Commons，用于注册表发现、已批准的数据集访问、任务感知划分、评估器指标、基准组…
*/pytorch-lightning
@K-Dense-AI
流程自动化开源协议: MIT
/**
* 深度学习框架（PyTorch Lightning / lightning 包）。将 PyTorch 代码组织为 LightningModules，配置 Trai…
*/pyzotero
@K-Dense-AI
流程自动化开源协议: MIT
/**
* 使用 pyzotero Python 客户端与 Zotero 文献管理库交互。通过 Zotero Web API v3 检索、创建、更新和删除条目、集合、标签与…
*/qiskit
@K-Dense-AI
编程协作开源协议: MIT
/**
* 使用 Qiskit 和 IBM Quantum Runtime 构建、模拟、转译并执行量子电路。适用于 Qiskit 2.x 电路与算符、V2 Sampler …
*/