K Dense Ai Scientific Agent Skills

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 * 如何使用 Adaptyv Bio Foundry API 和 Python SDK 进行蛋白质实验设计、提交以及结果获取。每当用户提及 Adaptyv、Foun…
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 * 此技能应用于时间序列机器学习任务，包括分类、回归、聚类、预测、异常检测、分割和相似性搜索。当处理需要超越标准机器学习方法的专业算法的时间数据、序列模式或时间索引…
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 * Plan, execute, and document validation, verification, and transfer of analytical
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 * Data structure for annotated matrices in single-cell analysis. Use when working
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 * 针对一个真实制品（代码、训练方案、智能体框架、数据流水线、提示词）以及目标和评估器，使用 Arbor 论文中的假设树精炼（Hypothesis Tree Ref…
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 * 使用可扩展算法（GRNBoost2、GENIE3）从基因表达数据推断基因调控网络（GRN）。适用于在分析转录组数据（批量 RNA-seq、单细胞 RNA-seq…
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 * 用于天文学与天体物理学工作流的核心 Python 库，可调用 Astropy 的 API，涵盖单位与量纲、坐标、FITS 读写、表格、时间系统、WCS 以及宇宙…
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 * 通过 screenpipe 观察用户的屏幕，检测重复出现的研究工作流，并将其与现有 scientific-agent-skills 进行匹配，为尚未覆盖的模式起…
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 * 用于注册实体、库存、ELN 条目、工作流、Benchling Apps 以及 Data Warehouse 查询的 Benchling Python SDK 和…
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 * 通过 BGPT MCP 服务器检索科学论文，并获取从全文研究中提取的结构化实验数据。每篇论文返回 25+ 个字段，包括方法、结果、样本量、质量评分和结论。适用于…
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 * 在处理 Brain Imaging Data Structure（BIDS）数据集时使用此技能：组织神经科学与生物医学数据（MRI、EEG、MEG、iEEG、P…
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 * 全面的分子生物学工具包。可用于序列操作、文件解析（FASTA/GenBank/PDB）、系统发育分析，以及以编程方式访问 NCBI/PubMed（Bio.Ent…
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 * 统一访问 40+ 生物信息服务（数据库）的 Python 接口。用于在单一工作流中以一致 API 查询多个数据库（UniProt、KEGG、ChEMBL、Rea…
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 * 端到端 bulk RNA-seq 编排器——从原始 FASTQ 测序读段出发，经过质控与剪切（FastQC、fastp/Trim Galore）、比对与定量（S…
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 * 以编程方式查询 CZ CELLxGENE Census 中的版本化公开单细胞和空间转录组数据。当你需要大规模人群级别的细胞元数据、基因表达切片、Census 汇…
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 * 谷歌量子计算框架。在面向 Google Quantum AI 硬件进行设计、构建噪声感知电路或运行量子表征实验时使用。最佳适用于 Google 硬件、噪声建模以…
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 * 面向学术研究的综合性引文管理。可在 OpenAlex、PubMed 和 Google Scholar 中检索论文，提取准确的元数据，校验引文，并生成格式规范的 …
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 * 准备并验证仅用于研究的临床决策支持评估、证据概要、队列、生存分析、生物标志物/模型、隐私与治理工件。适用于聚合或合成的研究文档与可追溯性,不用于患者护理或实时临…
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 * 为临床病例、诊断、试验、安全性和汇总研究报告创建安全受限的草稿结构，并运行本地确定性检查。仅与合成、去标识化或汇总数据以及经过核实的源事实清单配合使用；所有输出…
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 * 基于约束的代谢建模（COBRA）。包括 FBA、FVA、基因敲除、通量采样、SBML 模型，适用于系统生物学和代谢工程分析。
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 * 对任何问题、决策或创意挑战运行多视角的 Mind Council 审议。每当用户希望获得多元观点、需要协助做出艰难决策、请求召开议会/小组/董事会讨论、希望从多…
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 * 用于超内存 pandas/NumPy 工作流的分布式计算。当需要将现有 pandas/NumPy 代码扩展到超出内存或跨集群时使用。最适合并行文件处理、分布式机…
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 * 使用明确的接口端点、过滤器、分页和来源信息查询有据可查的公共数据库 API。当需要从某个具名来源以可复现的方式检索科学、监管、金融或其他由数据库支撑的事实，而不…
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 * 基于 RDKit 的 Pythonic 封装，提供简化的接口与合理的默认设置。适用于标准药物发现任务，包括 SMILES 解析、标准化、描述符、指纹、聚类、3D…
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