K Dense Ai Scientific Agent Skills

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 * 面向分子机器学习的库，提供多样的特征化方法与预构建数据集。当需要丰富的特征化选项和 MoleculeNet 基准，用于基于传统机器学习或图神经网络的性质预测（如…
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 * 使用 DeepSpot-M 从 H&E 病理图像生成全转录组的虚拟空间转录组数据。当你需要在约 20x 放大下以 224x224 图块获得 log1p-CPM …
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 * NGS 分析工具包。支持 BAM 到 bigWig 的转换、QC（相关性、PCA、指纹图）、热图/轮廓图（TSS、峰位），用于 ChIP-seq、RNA-seq…
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 * 查询癌症依赖性图谱（DepMap）以获取癌症细胞系基因依赖性评分（CRISPR Chronos）、药物敏感性数据以及基因效应谱。用于识别癌症特异性脆弱性、合成致…
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 * 从任意文本中提取认知模式与思维指纹。当用户希望分析某人的思维方式、理解认知风格、刻画写作或言语模式、比较不同人之间的思维风格，或提出诸如"我的思维风格是什么"、…
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 * DiffDock 与 DiffDock-L 分子对接。适用于基于 PDB 或序列加 SMILES/SDF/MOL2 的蛋白-小分子构象预测、批量对接、虚拟筛选以…
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 * 使用 dx CLI、dxpy、应用（app）/小程序（applet）、原生工作流、dxCompiler 和 Nextflow 在 DNAnexus 上构建和运行…
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 * 每当用户想要创建、读取、编辑或操作 Word 文档（.docx 文件）或 Word 模板（.dotx 文件）时，请使用此技能。触发条件包括：任何对“Word 文…
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 * 用于直接使用 `esm` Python SDK、ESM3 或 ESMC 模型 ID、Forge/Biohub 推理客户端，或 ESMFold2 折叠工作流时使用…
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 * 使用 ETE 4 对系统发育或其他层级树进行分析、操作、比较、注释与可视化。可用于 Newick/Nexus 树的读写、拓扑编辑与模式匹配、Robinson-F…
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 * 由 Exa 驱动的 Web 工具集，专为科学与技术内容调优。当用户需要搜索网页或抓取/提取 URL 内容时，请使用此技能。涵盖：网页搜索（语义查找、研究、当前信…
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 * 在数据收集之前设计实验和研究——选择设计方案、随机化、分区，以及安排处理组合，使结果可以被解读。当有人正在规划一项研究、询问如何将受试者/样本分配到各组、提到随…
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 * 对明确受支持的科学文件执行有界的、本地的探索性分析。用于已脱敏的 CSV/TSV/JSON 概览；可选的 NumPy、HDF5、FASTA/FASTQ 以及基础…
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 * 使用 FlowIO 读取、检查和写入流式细胞术标准（FCS）2.0、3.0 和 3.1 文件。适用于低层级 FCS 元数据与通道检查、NumPy 事件提取、多数…
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 * 规划、配置、检查、重启并分析有界的 FluidSim 计算流体动力学仿真，附带显式的数值有效性与 HPC 安全检查。用于 FluidSim 求解器选型、参数评审…
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 * 通过 OpenRouter Image API（Gemini、Seedream、Recraft、GPT-Image、Riverflow）使用 AI 模型生成或编…
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 * 使用 Geniml 进行已审计的本地基因组区间工作流：验证 BED 和 universe 契约，规划 Region2Vec 或 scEmbed 运行，检查模型/…
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 * 在坐标系约定之间转换基因组区间，对变异表示进行归一化和比较，并在装配体或重叠群命名不匹配破坏分析之前发现它们。每当坐标跨越格式、工具或装配体边界时使用——在 B…
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 * 使用 Genomic Intelligence 托管的 transformer DNA 语言模型，直接从 DNA 序列预测调控特征、基因结构和表达——无需本地 …
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 * 全面的地理空间科学技能，涵盖遥感、GIS、空间分析、地球观测机器学习以及 30 多个科学领域。支持卫星影像处理（Sentinel、Landsat、MODIS、S…
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 * 针对直接使用 GeoPandas GeoSeries、GeoDataFrame、空间操作或矢量数据 I/O 的 Python 工作流，提供指导与本地审计工具。
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 * 当用户请求资源感知的规划，或在执行明显的资源敏感型本地工作负载之前，检测主机清单以及 CPU、内存、磁盘、调度器、容器和加速器的有效限制。生成一份经过脱敏的 J…
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 * 面向 20+ 生物信息学数据库的高速 CLI/Python 查询工具。适用于快速查找：基因信息、BLAST/BLAT、病毒序列下载、AlphaFold 结构、富…
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 * 在 Ginkgo Bioworks Cloud Lab（cloud.ginkgo.bio）上提交和管理 protocol，该平台是基于网页的远程访问界面，可在可…
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