关于 Scanpy MCP server
Scanpy MCP server 是一款面向单细胞测序研究场景的 MCP（Model Context Protocol） 工具，把热门 Python 库 Scanpy 的核心能力封装成 AI 可直接调用的服务，让你用自然语言就能完成单细胞数据分析。
它能接什么
- 常规流程一句话搞定：质控、归一化、高变基因筛选、PCA / UMAP / t-SNE 降维、聚类（如 Leiden）、差异表达、Marker 基因查找等。
- 与 AI 助手无缝协作：通过 MCP 协议接入 Claude、Cursor、Cline 等支持 MCP 的客户端，对话中即可触发分析步骤并返回结果。
- 科研数据常用格式：支持
.h5ad、10x Genomics输出、AnnData 对象等常见输入输出。
是否需要密钥
通常不需要额外的 API Key，以本地或自托管方式运行即可；如部署在远端或走企业内部网关，可能需要按其鉴权方式配置访问令牌，具体以部署环境为准。
适合谁用
- 想加快 scRNA-seq 探索流程、不想反复手写代码的科研人员。
- 希望把单细胞分析能力嵌入 AI 工作流的生物信息团队。
